觉醒的拉斐尔有着达芬奇发疯之前所有的记忆，当然也记着自己的女友。
某一天，拉斐尔占据了身体，他似乎感觉不到了达芬奇的存在。
欣喜若狂的拉斐尔感觉自己获得了重生，他冲出小镇，去寻找自己的女友。
找到女友后，女友也非常高兴，两个人坠入爱河，女友也有了拉斐尔的爱情结晶。
一天深夜，拉斐尔从梦中醒来，自己的大脑中有一个声音在喊，那是他再熟悉不过的声音。
拉斐尔慌了，他知道，达芬奇可能要回来了。
尽管拉斐尔不停地在抵抗，但是达芬奇还是重新占据了身体。
达芬奇将女友抓回了自己的豪宅，关在了地牢里面，他需要新生的婴儿做生化实验。
达芬奇抓的人越来越多，都被他关在了地牢里面，成为了准备做生化实验的小白鼠。
偶尔恢复神智的拉斐尔知道这样下去不行，可又无可奈何。
于是他想了一个办法，那就是趁达芬奇不得不休息的时候，重新占据身体，给地牢中的人留下了逃离这里的笔记。
只需要三个笔记，就能够引导地牢中的人逃离这里。
达芬奇发现了地牢中的人有时会变少，检查后才知道，拉斐尔做了点小手脚。
原来达芬奇一直都知道拉斐尔的存在，并利用过他很多次。
女友的事情，也是达芬奇一手策划的，他故意让拉斐尔控制身体，就是为了让拉斐尔以为自己已经不在了，让拉斐尔去找那个可怜的女人。
这次达芬奇也是一样，他利用了拉斐尔的逃脱笔记。
达芬奇将第三本逃脱笔记替换掉了。
由于本身就是一个人，所以达芬奇写的逃脱笔记的字迹是和拉菲尔的逃脱笔记一模一样的。
达芬奇故意将想逃离这里的人引到了下水道中。
下水道的入口是特制的，只能从外面打开，除了达芬奇，任何人都无法从下水道内部打开入口。
就这样，无数想要逃离这里的人，都直接跑到了达芬奇的实验室中去，成为了实验材料。
拉斐尔终于察觉到了这件事情，他万念俱灰，原来自己一直在被达芬奇利用着。
恢复神智的他，在达芬奇卧室中的一张纸上，未来到这里的遇难者写下了指引他们逃脱的最后办法。
但是还没等写完，达芬奇就醒了过来。
……
“原来是这样吗？”烽火黑日撇了撇嘴：“真是个坑爹剧情！拉斐尔最后想让我们杀掉什么啊？”
“我想，”夏日公主表情严肃，“我想拉菲尔想让我们杀掉的，就是达芬奇吧。
在拉斐尔写的第四张纸上，笔记还没有完全干，拉斐尔是想指导着被达芬奇骗来的我们逃出去的，
但是拉斐尔可能意识到，无论怎么样，我们都无法逃出达芬奇的魔掌，